Безопасно ли пользоваться OnyX?

Да, если не отмечать всё подряд. Программа существует больше двадцати лет и выполняет штатные операции macOS. Самое неприятное, что может случиться при бездумной чистке, — Mac несколько минут будет медленнее, пока пересоздаст кэши и индекс поиска, а браузеры попросят заново войти на сайты.

OnyX не запускается и пишет про версию системы

Вы скачали версию для другой macOS. Проверьте номер своей системы в меню Apple → «Об этом Mac» и возьмите на сайте разработчика версию ровно под неё.

Чем OnyX отличается от CleanMyMac?

OnyX бесплатна и технична: она делает служебные операции и открывает скрытые настройки, но не объясняет каждую находку и не удаляет программы с остатками. CleanMyMac платная, с понятным интерфейсом, удалением программ и проверкой на вредоносное ПО. Для починки Spotlight и ассоциаций файлов OnyX подходит лучше, для «нажать и понять» — CleanMyMac.

Как часто запускать обслуживание?

Не по расписанию, а по необходимости: когда что-то сломалось — поиск, ассоциации файлов, шрифты — или когда нужно освободить место. Регулярная чистка кэшей «для профилактики» пользы не приносит.